Old engine for Continuous Time Bayesian Networks. Superseded by reCTBN. 🐍
https://github.com/madlabunimib/PyCTBN
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import os
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import glob
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import pandas as pd
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import numpy as np
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class Importer():
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"""Importer forisce tutti i metodi per importare i dataset in input in pandas data_frame ed effettuare operazioni
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volte ad ottenere i valori contenuti in tali frame nel formato utile alle computazioni sui dati.
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:files_path: il path alla cartella contenente i dataset da utilizzare
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:df_list: lista contentente tutti i padas_data_frame che saranno importati
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"""
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def __init__(self, files_path):
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self.files_path = files_path
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self.df_list = []
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self.trajectories = []
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def import_data_from_csv(self):
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"""Importa tutti i file csv presenti nel path files_path in data_frame distinti.
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Aggiunge ogni data_frame alla lista df_list.
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Parameters:
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void
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Returns:
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void
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"""
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read_files = glob.glob(os.path.join(self.files_path, "*.csv"))
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for file in read_files:
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my_df = pd.read_csv(file) #TODO:Aggiungere try-catch controllo correttezza dei tipi di dato presenti nel dataset e.g. i tipi di dato della seconda colonna devono essere float
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self.df_list.append(my_df)
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def merge_value_columns(self, df):
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""" Effettua il merging di tutte le colonne che contengono i valori delle variabili in un unica colonna chiamata State.
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Parameters:
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df: il data_frame su cui effettuare il merging delle colonne
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Returns:
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void
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"""
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df['State'] = df[df.columns[2:]].apply(lambda row: ''.join(row.values.astype(str)), axis=1)
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def get_data_frames(self):
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return self.df_list
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def clear_data_frames(self):
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for data_frame in self.df_list:
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data_frame = data_frame.iloc[0:0]
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def build_trajectories(self):
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for data_frame in self.df_list:
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self.merge_value_columns(data_frame)
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trajectory = data_frame[['Time','State']].to_numpy()
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self.trajectories.append(trajectory)
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#Clear the data_frame
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data_frame = data_frame.iloc[0:0]
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imp = Importer("../data")
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imp.import_data_from_csv()
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imp.build_trajectories()
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print(imp.trajectories[0])
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