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Old engine for Continuous Time Bayesian Networks. Superseded by reCTBN. 🐍 https://github.com/madlabunimib/PyCTBN
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PyCTBN/main_package/classes/importer.py

81 lines
2.2 KiB

import os
import glob
import pandas as pd
import numpy as np
class Importer():
"""Importer forisce tutti i metodi per importare i dataset in input in pandas data_frame ed effettuare operazioni
volte ad ottenere i valori contenuti in tali frame nel formato utile alle computazioni sui dati.
:files_path: il path alla cartella contenente i dataset da utilizzare
:df_list: lista contentente tutti i padas_data_frame che saranno importati
"""
def __init__(self, files_path):
self.files_path = files_path
self.df_list = []
self.trajectories = []
def import_data_from_csv(self):
"""Importa tutti i file csv presenti nel path files_path in data_frame distinti.
Aggiunge ogni data_frame alla lista df_list.
Parameters:
void
Returns:
void
"""
read_files = glob.glob(os.path.join(self.files_path, "*.csv"))
for file in read_files:
my_df = pd.read_csv(file) #TODO:Aggiungere try-catch controllo correttezza dei tipi di dato presenti nel dataset e.g. i tipi di dato della seconda colonna devono essere float
self.df_list.append(my_df)
def merge_value_columns(self, df):
""" Effettua il merging di tutte le colonne che contengono i valori delle variabili in un unica colonna chiamata State.
Parameters:
df: il data_frame su cui effettuare il merging delle colonne
Returns:
void
"""
df['State'] = df[df.columns[2:]].apply(lambda row: ''.join(row.values.astype(str)), axis=1)
def get_data_frames(self):
return self.df_list
def clear_data_frames(self):
for data_frame in self.df_list:
data_frame = data_frame.iloc[0:0]
def build_trajectories(self):
for data_frame in self.df_list:
self.merge_value_columns(data_frame)
trajectory = data_frame[['Time','State']].to_numpy()
self.trajectories.append(trajectory)
#Clear the data_frame
data_frame = data_frame.iloc[0:0]
imp = Importer("../data")
imp.import_data_from_csv()
imp.build_trajectories()
print(imp.trajectories[0])