Added DOCSTRING and Comments to most of the classes; Some refactorings on methods

.gitignore

@@ -1 +1,2 @@
-__pycache__
+__pycache__
+.vscode

main_package/classes/dynamic_graph.py

@@ -4,6 +4,18 @@ import node
 
 
 class DynamicGraph():
+    """
+    Rappresenta un grafo dinamico con la seguente struttura:
+        {Key: {Arcs:{node_object: #in_arcs.....}, Time:t, Node:node_object}.....}
+        Key = lo state_id del nodo
+        Arcs = la lista di adiacenza del nodo identificato dalla stringa state_id, contenente oggetti di tipo Node
+        Time = lo state residence time del nodo identificato dalla stringa state_id
+        Node = L'oggetto Node con lo stesso state_id  pari a Key e node_id opportunamento inizalizzato
+
+        :sample_path: le traiettorie/a da cui costruire il grafo
+        :graph: la struttura dinamica che definisce il grafo
+        :states_number: il numero di nodi contenuti nel grafo graph
+    """
 
     def __init__(self, sample_path):
         self.sample_path = sample_path
@@ -11,6 +23,10 @@ class DynamicGraph():
         self.states_number = 0
 
     def initialize_graph(self, trajectory):
+        """
+        Data la traiettoria trajectory inizializza le chiavi del dizionario graph e crea le opportune sottostrutture interne.
+
+        """
         for(node_id,state) in enumerate(trajectory.get_states()):
             n = node.Node(state, node_id)
             self.graph[state] = {"Arcs":{}, "Time":0.0, "Node":n}
@@ -24,30 +40,55 @@ class DynamicGraph():
             self.add_transaction(matrix_traj, indx)
 
     def add_transaction(self, matrix_traj, indx):
+        """
+            Aggiunge la transizione dal nodo current_state al nodo next_state e aggiorna lo state residence time del nodo
+            con chiave current_state.
+
+            Parameters:
+                matrix_traj: la traiettoria con cui si sta costruendo il grafo graph
+                indx: la posizione nella visita
+            Returns:
+                void
+        """
         current_state = matrix_traj[indx][1]
         next_state = matrix_traj[indx + 1][1]
         self.graph[current_state]["Time"] += matrix_traj[indx + 1][0] - matrix_traj[indx][0]
-        next_node = self.graph[next_state]["Node"]
+        next_node = self.graph[next_state]["Node"] #Punta all'oggeto Node con node_id precedentemente settato
-        if next_node not in self.graph[current_state]["Arcs"].keys():
+        if next_node not in self.graph[current_state]["Arcs"].keys():  #Se non hai ancora incontrato next_node inizializza il numero di archi entranti
             self.graph[current_state]["Arcs"][next_node] = 1
         else:
             self.graph[current_state]["Arcs"][next_node] += 1
     
     def append_new_trajectory(self, trajectory):
+        """
+        Aggiunge i risultati di una nuova esplorazione trajectory al grafo graph.
+
+        Parameters:
+            trajectory: la traiettoria da aggiungere
+        Returns:
+            void
+        """
+        
         matrix_traj = trajectory.get_trajectory_as_matrix()
-        for indx in range(len(matrix_traj) - 1):
+        
+        current_state = matrix_traj[0][1] #Aggiungi se necessario i primi due stati
+        next_state = matrix_traj[1][1]
+        self.add_node_if_not_present(current_state) 
+        self.add_node_if_not_present(next_state) 
+        self.add_transaction(matrix_traj, 0)
+        
+        for indx in range(1, (len(matrix_traj) - 1)):
             current_state = matrix_traj[indx][1]
             next_state = matrix_traj[indx + 1][1]
-            if current_state not in self.graph.keys():
+            self.add_node_if_not_present(next_state) 
-                current_node = node.Node(current_state, self.states_number)
-                self.graph[current_state] = {"Arcs":{}, "Time":0.0, "Node":current_node}
-                self.states_number += 1
-            if next_state not in self.graph.keys():
-                next_node = node.Node(next_state, self.states_number)
-                self.graph[next_state] = {"Arcs":{}, "Time":0.0, "Node":next_node}
-                self.states_number += 1
             self.add_transaction(matrix_traj, indx)
 
+    def add_node_if_not_present(self, current_state):
+        if current_state not in self.graph.keys(): #Se non hai ancora incontrato il lo state current_state
+            current_node = node.Node(current_state, self.states_number) #Crea il l'oggetto con opportuno node_id
+            self.graph[current_state] = {"Arcs":{}, "Time":0.0, "Node":current_node} #Aggiungilo al dizionario graph
+            self.states_number += 1
+
     def build_graph(self):
         for indx, trajectory in enumerate(self.sample_path.trajectories):
             if indx == 0:

main_package/classes/importer.py

@@ -7,37 +7,44 @@ import numpy as np
 
 
 class Importer():
-    """Importer forisce tutti i metodi per importare i dataset in input in pandas data_frame ed effettuare operazioni
+    """
-        volte ad ottenere i valori contenuti in tali frame nel formato utile alle computazioni sui dati.
+    Fornisce tutti i metodi per importare i dataset contenuti nella directory files_path 
+    in pandas data_frame. 
+    Permette di effettuare operazioni
+    volte ad ottenere i valori contenuti in tali frame nel formato utile alle computazioni successive.
     
     :files_path: il path alla cartella contenente i dataset da utilizzare
-    :df_list: lista contentente tutti i padas_data_frame che saranno importati
+    :df_list: lista contentente tutti i padas_data_frame contenuti nella directory files_path
     """
     def __init__(self, files_path):
         self.files_path = files_path
         self.df_list = []
-        #self.trajectories = []
+        
 
     def import_data_from_csv(self):
-        """Importa tutti i file csv presenti nel path files_path in data_frame distinti.
+        """
-            Aggiunge ogni data_frame alla lista df_list.
+        Importa tutti i file csv presenti nel path files_path in data_frame distinti.
-
+        Aggiunge ogni data_frame alla lista df_list.
-    Parameters:
+        Parameters:
-        void
+            void
-
+        Returns:
-    Returns:
+            void
-        void
+         """
+        try:
+            read_files = glob.glob(os.path.join(self.files_path, "*.csv"))
+            for file in read_files:
+                my_df = pd.read_csv(file)
+                self.check_types_validity(my_df)
+                self.df_list.append(my_df)
+        except ValueError as err:
+            print(err.args)
 
-   """
-        read_files = glob.glob(os.path.join(self.files_path, "*.csv"))
-        for file in read_files:
-            my_df = pd.read_csv(file) #TODO:Aggiungere try-catch controllo correttezza dei tipi di dato presenti nel dataset e.g. i tipi di dato della seconda colonna devono essere float
-            self.df_list.append(my_df)
         
 
     def merge_value_columns(self, df):
-        """ Effettua il merging di tutte le colonne che contengono i valori delle variabili in un unica colonna chiamata State.
+        """ 
-
+        Effettua il merging di tutte le colonne che contengono i valori delle variabili 
+        in un unica colonna chiamata State.
         Parameters:
             df: il data_frame su cui effettuare il merging delle colonne 
         Returns:
@@ -45,27 +52,75 @@ class Importer():
         """
         df['State'] = df[df.columns[2:]].apply(lambda row: ''.join(row.values.astype(str)), axis=1)
 
+    def merge_value_columns_in_all_frames(self):
+        """
+        Richiama il metodo  merge_value_columns su tutti i data_frame contenuti nella df_list
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            void
+
+         """
+        for data_frame in self.df_list:
+            self.merge_value_columns(data_frame)
+
     def drop_unneccessary_columns(self, df):
+        """
+        Rimuove le colonne contenenti i valori delle variabili dal data_frame df.
+        Parameters:
+            df: il data_frame su cui rimuovere le colonne
+        Returns:
+            void
+
+         """
         cols = df.columns.values[2:-1]
         print(cols)
         df.drop(cols, axis=1, inplace=True)
 
     def drop_unneccessary_columns_in_all_frames(self):
+        """
+        Richiama il metodo drop_unneccessary_columns su tutti i data_frame contenuti nella df_list
+
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            void
+
+         """
         for data_frame in self.df_list:
             self.drop_unneccessary_columns(data_frame)
 
-    def merge_value_columns_in_all_frames(self):
-        for data_frame in self.df_list:
-            self.merge_value_columns(data_frame)
-    
     def get_data_frames(self):
+        """
+        Restituisce la lista contenente tutti i data_frames caricati in df_list.
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            data_frames list
+         """
         return self.df_list
 
     def clear_data_frames(self):
+        """
+        Rimuove tutti i valori contenuti nei data_frames presenti in df_list
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            void
+         """
         for data_frame in self.df_list:
             data_frame = data_frame.iloc[0:0]
 
 
+    def check_types_validity(self, data_frame):  #Solo un esempio di controllo sui valori contenuti nel dataset
+        """
+        Controlla la correttezza dei tipi contenuti nei dati caricati nel data_frame (in questo caso solo che nella seconda colonna siano contenuti dei float)
+         """
+        if data_frame.iloc[:,1].dtype != np.float64:
+            raise ValueError("The Dataset is Not in the correct format")
+
+        #TODO Integrare i controlli di correttezza sul dataset e capire quali assunzioni vanno fatte
+
 
 
 

main_package/classes/node.py

@@ -1,6 +1,13 @@
 
 
 class Node():
+    """
+    Astrae il concetto di nodo appartenente ad un grafo G.
+    Un nodo viene univocamente identificato dal suo state_id, il tag node_id è utilizzato per stabilire la posizione
+    del nodo stesso nel grafo rappresentato attraverso la matrice di adiacenza.
+    :state_id: UID del nodo
+    :node_id: int
+    """
 
     def __init__(self, state_id, node_id=-1):
         self.state_id = state_id
@@ -12,7 +19,16 @@ class Node():
     def __hash__(self):
         return hash(self.__key())
 
+    
     def __eq__(self, other):
+        """
+        Controlla l'uguaglianza di due oggetti Node.
+        Due nodi sono uguali sse hanno lo stesso state_id
+        Parameters:
+            other: oggetto nodo con cui effettuare il confronto
+        Returns:
+            boolean
+        """
         if isinstance(other, Node):
             return self.__key() == other.__key()
         return NotImplemented

main_package/classes/sample_path.py

@@ -6,6 +6,14 @@ import trajectory as tr
 
 
 class SamplePath():
+    """
+    Rappresenta l'aggregazione di una o più traiettorie.
+    Ha il compito dato di costruire tutte gli oggetti Trajectory a partire
+    dai dataset contenuti nella directory files_path.
+
+    :importer: l'oggetto Importer che ha il compito di caricare i dataset
+    :trajectories: lista contenente le traiettorie create
+    """
 
     def __init__(self, files_path=os.getcwd() + "/main_package/data"):
         self.importer = imp.Importer(files_path)
@@ -26,11 +34,4 @@ class SamplePath():
 
 
 
-######Veloci Tests#######
-
-s1 = SamplePath()
-s1.build_trajectories()
-print(s1.get_number_trajectories())
-#print(s1.trajectories[0].get_trajectory())
-
 

main_package/classes/trajectory.py

@@ -3,15 +3,35 @@ import numpy as np
 
 
 class Trajectory():
+    """ 
+    Rappresenta una traiettoria come un data_frame contenente coppie (T_k,S_i) => (numpy.float64, string)
+    Offre i metodi utili alla computazione sulla struttura stessa.
+    :actual_trajectory: il data_frame contenente la successione di coppie (T_k,S_i)
+
+    """
 
     def __init__(self, data_frame):
         self.actual_trajectory = data_frame
         
     def get_trajectory(self):
         return self.actual_trajectory
-    
+
     def get_trajectory_as_matrix(self):
+        """
+        Converte il data_frame actual_trajectory in formato numpy.array
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            numpy.array
+        """
         return self.actual_trajectory[['Time','State']].to_numpy()
 
     def get_states(self):
+        """
+        Identifica gli stati visitati nella traiettoria.
+        Parameters:
+            void
+        Returns:
+            una lista contenente gli stati visitati nella traiettoria
+        """
         return self.actual_trajectory['State'].unique()